| あ | か | さ | た | な | は | ま | や | ら | わ |
| メダロット名 | モチーフ | 登場作品 |
| サーキュリス | サキュバス | 2・R・弐CORE・DS・7・8・9・S |
| サークレッド | 天使 | navi |
| サーゴード | 沙悟浄 | R・OCG・4・S |
| サーチラット | ネズミ | 2・R・navi・弐CORE |
| サーティーン | カマキリ | DS・7・DUAL・8・9・GM・S |
| サイカチス | カブトムシ | 3・OCG・4・navi・BRAVE・DS・7・DUAL・8・9・GM・S |
| サイクロッサー | サイクロプス | R |
| サイゴブ | スカンク | 5・G |
| サイショウグンシ | 孔明 | 7・DUAL・8・9・GM・S |
| サイズカッター | カマキリ | OCG・navi |
| サイドキッキー | 名犬 | S |
| サイドムーブ | カニ | 7・8・9・S |
| サイドワイズ | トカゲ | OCG・navi |
| サイビスター | ゲンゴロウ | 9・S |
| サイレントリーフ | クロコサギ | OCG・navi |
| さくらちゃん | ダンシングフラワー | 2・R・弐CORE |
| さくらちゃんZ | ダンシングフラワー | DS・7・DUAL・8・9・GM・S |
| サジタリウス | 射手座 | navi・S |
| サニヅラウ | ガール | 5・G |
| サボテンナ | サボテン | 2・R・弐CORE |
| サマーソルト | トンボ | navi |
| サムライ | 侍 | 1・2・R・カード・OCG・4・弐CORE・7・DUAL・8・9・GM・S |
| サラシナヒメ | 鬼姫 | S |
| サルベーション | アズラエル | 8・9 |
| サンウィッチー | 魔女 | 2・R・弐CORE・S |
| サンジューロ | クワガタムシ | DS・7・DUAL・8・9・GM・S |
| サンニンジャ | 忍者 | navi |
| メダロット名 | モチーフ | 登場作品 |
| G・O・デス | 死神 | 3・OCG・4・8・9・S |
| ジ・エッジ | ヘリコプター | 7・8・9 |
| ジ・エンシェント | 龍 | 2・R・弐CORE・S |
| シーオッター | ラッコ | OCG・navi |
| シーカウ | ウミウシ | 5 |
| シーカミング | カニ | 5 |
| シーガル | 十二支(辰) | R・S |
| シーキャッチャー | アノマロカリス | 3・OCG・4・8・9・S |
| シークラウン | イソギンチャク | 5 |
| シーシーマックス | レモン | 5 |
| シーシール | アザラシ | R |
| シーホース | セイウチ | 5 |
| シーモンスター | ハルゲキニア | 3・OCG・4 |
| シアンドッグ | イヌ | 1・2・R・カード・4・navi・弐CORE・8・9・S |
| シィアンロン | ドラゴン | 9・S |
| ジェットドライバ | パイロット | 5 |
| ジェニアス | 麒麟 | 3・OCG・4・S |
| Gスピノ・S | ゾイドワイルドZERO/ジェノスピノ | S |
| ジェミナスタゴ | 双子座 | R |
| ジェミニ | 双子座 | navi・S |
| シェルクッション | 貝 | 1・2・R・カード |
| ジェントルカーゴ | ペリカン | R |
| ジェントルハーツ | ジャイアントゴーレム | 2・R・弐CORE・S |
| ジオディーゼル | トラクター | 5 |
| シサク1ゴウ | 兵器 | 8・9・S |
| シサク2ゴウ | 兵器 | 8・9・S |
| シサク3ゴウ | 兵器 | 8・9・S |
| ジッキー | 掃除機 | 4 |
| シックルカッター | カマキリ | OCG・navi・9・S |
| シティラッシャー | バス | 5 |
| シミタートゥース | サーベルタイガー | 7・DUAL・8・9・GM・S |
| ジャートフェイジ | 飛行機 | 真型 |
| シャーフー | カラカル | 7・8・9・S |
| シャーマンミコ | 巫女 | R・7・8・9・S |
| シャイニースター | 妖精 | 8・9・S |
| シャインシール | アザラシ | 3・OCG・4 |
| ジャクハッチー | スズメバチ | 5 |
| ジャコウネコカ | マングース | 4 |
| ジャッカル | トランプ「ジャック」 | 3・OCG・4・S |
| シャペロルージュ | 赤ずきん | DUAL・8・9・GM・S |
| ジャンガリアン | キヌゲネズミ | 5・G・9・S |
| ジャングルギボン | テナガザル | 5 |
| シュートスパイダ | クモ | 2・R・弐CORE・BRAVE・DS・DUAL・7・8・9・GM・S |
| ジューラック | キク | 5 |
| ジュウーク | グラントシロカブト | 9・S |
| シュシュタイト | ウサギのぬいぐるみ | 7・8・9 |
| シュシュポップ | ガールズバンド・ボーカル | S |
| シュシュポップ２? | ガールズバンド・ボーカル | S |
| シュタインベルガ | フランケンシュタイン | GM・S |
| シュッポード | 蒸気機関車 | S |
| ジュラシッキング | レックス | 5 |
| シュリンプレッサ | 伊勢海老 | 3・OCG・4 |
| ジュロウナンチー | 七福神(寿老人) | S |
| 初号機S | エヴァンゲリオン/エヴァンゲリオン初号機 | S |
| ジラスジダス | エリマキトカゲ | 7・8・9 |
| シラミン | シラミ | 3・OCG・4 |
| ジラフチーフ | キリン | navi |
| シルバリオン | 銀狼 | OCG・navi |
| シルベリアル | フルメタル・パニック！/ベリアル | S |
| シンザン | クワガタ | OCG・5・8・9・S |
| ジンジャオー | 金閣 | DUAL・9・S |
| シンセイバー | 新撰組 | R・OCG・4・7・8・9・S |
| メダロット名 | モチーフ | 登場作品 |
| スーパーエクスペ | 新幹線 | navi・9 |
| スィーカマー | セイレーン | 3・OCG・4・8・9・S |
| スィート | バッタ | OCG・navi |
| スイートネクター | ミツバチ | navi |
| スイマーメイツ | スクール水着 | 8・9・S |
| スカイカーゴ | 飛行機 | 3・OCG・4 |
| スカイプテラ | プテラノドン | 3・OCG・4 |
| スカルタクス | 金太郎 | 真型 |
| スキルタッカー | タカ | 5 |
| スキンリーク | ダニ(?) | navi |
| スコルピート | 蠍座 | R |
| スコルピオ | 蠍座 | OCG・navi・S |
| スタブシュライク | 百舌鳥 | 9・S |
| スターペンタゴン | ヒトデ | 2・R・弐CORE |
| スチールストーク | ハシビロコウ | 8・9・S |
| スティドリアード | ドリアード | 3・OCG・4・8・9・S |
| ストールボート | ヒヨコ | 3・OCG・4 |
| ストライクホーン | ユニコーン | 7・8・9 |
| ストランジェロ | 天使 | 真型 |
| ストレイウォルフ | オオカミ | 3・OCG・4・navi |
| ストロベミルク | イチゴ | 5 |
| ストンミラー | メデューサ | 2・R・弐CORE・S |
| スネークィーン | メデューサ | DUAL・9・GM |
| スノーフェンリル | オオカミ | 5・7・DUAL・8・9・GM・S |
| スピードアラート | パトカー | 7・DUAL・8・9・GM・S |
| スパイン | 探査ポッド | 3・OCG・4 |
| スフィンク | 朱雀 | 3・OCG・4 |
| スプライトゥス | 十二支(寅) | R・S |
| スペナグメノーグ | 阿修羅 | DS・7・8・9・S |
| スポアーパラソル | キノコ | OCG・4 |
| スミロドナッド | サーベルタイガー | 2・R・カード・3・OCG・4・G・弐CORE・8・9・S |
| スモールチドリー | コチドリ | 5 |
| スライムエール | ウナギ | 3・OCG・4 |
| スラップビート | ガールズバンド・ベース | GM・S |
| スレッドドッグ | 雪山救助犬 | 4 |
| スワロウテイル | キャバクラ嬢 | 8・9・S |
| メダロット名 | モチーフ | 登場作品 |
| ゼーゲホルン | タテヅノカブト | 8・9・S |
| セーラーマルチ | 女子学生 | 2・R・カード・OCG・navi・G・弐CORE・BRAVE・DS・7・DUAL・8・9・GM・S |
| セーラーメイツ | 女子学生 | 1・2・R・カード・弐CORE・8・9・S |
| セイテイキング | オニヤンマ | 9・S |
| セイバードラゴン | 魔神英雄伝ワタル/龍神丸 | S |
| セキゾー | 二宮金次郎像 | 1・2・R・カード・弐CORE・9・S |
| セットステゴ | ステゴザウルス | 3・OCG・4 |
| セットチューター | 家庭教師 | OCG・4 |
| ゼニメンダルダル | 小銭・メダル | R |
| セブンカラーズ | カメレオン | 1・2・R・カード・弐CORE・BRAVE・DS・7・8・9・S |
| セブンスラッガー | ULTRAMAN/SEVEN SUIT | S |
| セミシケード | セミ | 3・OCG・4・S |
| セルヴォ | クワガタムシ | 真型・9・S |
| ゼロスーサイド | ? | navi |
| センチペイド | ムカデ | 3・OCG・4 |
| セントナース | 看護婦 | 2・R・OCG・G・弐CORE・BRAVE・DS・7・DUAL・8・9・GM・S |
| メダロット名 | モチーフ | 登場作品 |
| ソードブルース | ロックマンエグゼ/ブルース | S |
| ゾーリン | クワガタムシ | 2・R・OCG・弐CORE・9・S |
| ソコオッター | ラッコ | OCG・4 |
| ゾッコー | 冷蔵庫 | 4 |
| ソニックスタッグ | クワガタムシ | OCG・navi・8・9・S |
| ソニックタンク | ハリネズミ | 2・R・弐CORE・S |
| ソフトアメーバ | アメーバ | 3・OCG・4 |
| ソラテス | ザリガニ | 真型 |
| ソリットコテージ | 家 | navi |
