その１：オープニングにて、スネークが墓の前で敬礼した直後。
その２：オープニングにて、スネークの「FOXDIEの事もある」の台詞の直後。
その３：オープニングにて、その２の後の、スネーク「ナオミか…」の直後。
その４：オープニングにて、ヘリに乗り込んだあとのリキッドについての会話の中で、オタコンの「リキッドが動き出した」の直後。
その５：メタルギアMｋⅡ登場。オタコン「REXと同じ　メタルギアだ」の台詞の直後。
その６：ジョニー（アキバ）と対面。スネーク「 安全装置 (セィフティ)がかかってるぞ、 新米 (ルーキー)」の直後。
その７：ラットパトロール０１と合流。メリルがバラクラバを取った時。
その８：ジョニー腹痛を起こす。「ちょっと…腹が…」の台詞が始まった辺り。
その９：リキッドの居るキャンプにて、リキッド・オセロット初登場時の名前テロップが出た辺り。
その１０：ナオミ・ハンター登場、スネークがナオミを見上げ「ナオミ…」と呟いた直後。

その１１：オタコン「心配ないよ、彼女たちも無事だ」の直後。
その１２：オタコン「PMCの中には心停止した者までいる」の後。
その１３：ナオミのビデオメール。「9年前のシャドーモセス事件で、スネーク、あなたの体内にも注入したもの」の直後。